Všechny pokoje v hotelu Svatý Tomáš jsou vybaveny koupelnou s vlastním WC, satelitní televizí (sekce "A"), telefonem s přímou volbou, trezorem a část pokojů má minibary.
Wifi signál v hotelu pokrývá:
restauraci
školící místnosti
část pokojů A a A3, A7
odpočinkovou zónu
Rozdělení kvality pokojů: Prezidentské apartmá – A11 (koupelna má jak sprchový kout tak vanu) o rozloze 90 metrů čtverečních. Apartmány nadstadard – D1, A1 bezbariérový přístup a koupelna má jak sprchový kout tak vanu. Apartmány standard – C5, C8.
Pokoje sekce A = zámecká část = nadstandard EU. Pokoje sekce B a C = standard EU = některé pokoje mají oddělená lůžka. B1 - B4, C6 - C7, apartmán C5 a C8).
Pokoje řady A – nadstandard – třílůžkové A2 (koupelna má jak sprchový kout tak vanu), A4. Pokoje řady A – nadstandard dvoulůžkové A3 (koupelna má jak sprchový kout tak vanu), A5 ( s balkonem), A6, velkoprostorové. Pokoje řady A – nadstandard, dvoulůžkové A7, A8, A9. Pokoje řady B – standard – B1, B2, B3, B4. Pokoje řady C – standard – C6, C7.